вы ерундой занимаетесь: вам же там объяснили (где я +1 поставил), что когда продолбано что-то с файловой системой линукс тут не при делах -- файлами занимается винда, а линукс видит ровно те файлы, которые ему винда покажет, хоть с самбой хоть без. Найдите "life system" (например Knoppix) и запустите её с вставлятельного носителя (цд, флешка, диск на шнурке, что угодно). И разберитесь как с её помощью получить доступ к файловой системе (я не уверен, что он умеет, но скорее есть надежда)

Кстати почему вы хотите стереть этот файл? если просто потому что он очень большой и жалко места, может попробовать его укоротить, типа "echo > файл" или как это на языке винды пишут. Не то чтоб это решение, но хоть что-то...